8月7日上午当地时间10点30分左右，肯尼亚首都内罗毕市中心，停放在美国使馆右侧一栋政府大楼门外的汽车炸弹突然爆炸，爆炸使美使馆建筑严重受损，此外两辆满载乘客的公共汽车正好驶过爆炸地点，车上22人被当场炸死。
10点50分左右，美国驻坦桑尼亚使馆的一辆丰田牌七吨运水车又发生了爆炸。在这两场惨绝人寰的大爆炸中，死亡人数超过250人、伤5000多人。
8月7日凌晨，睡梦中的克林顿被国家安全助理伯杰唤醒，得知这一噩耗，当即表示：“我们将动用一切手段，不管代价多高，时间多长，一定要将肇事者绳之以法。”
美国国务卿奥尔布赖特得悉这两起爆炸事件后，中断了她在意大利的私人访问，立刻返回美国。国务院成立一个特别行动小组来处理这两次爆炸事件。美国国务卿奥尔布赖特宣布，只要有人能够提供信息使爆炸案凶手被缉拿归案并定罪，美国将向其提供200万美元的奖赏。
8日上午美国空军已派出两架军用飞机，携带医疗小组以及负责撤离工作的人员，分别前往出事地点。联邦调查局也派出一个由数百人组成的特别行动小组和通讯联络人员前往肯尼亚和坦桑尼亚。
美国专家在现场查看了爆炸物及所用车辆，认为这是行家精心策划。虽有匿名电话尚无直接证据，但可以确定爆炸系伊斯兰极端组织所为。
在肯尼亚和坦桑尼亚先后有19人被拘留并接受调查询问。美国越来越怀疑沙特阿拉伯亿万富翁拉登是这两起恐怖爆炸事件的幕后支持者。
8月16日，巴基斯坦外交部证实，一名自称穆罕默德·萨迪克·侯瓦达的男子本月7日在抵达卡拉奇机场时被捕。经审讯，巴有关部门认为他参与了这两起恐怖主义爆炸事件，并移交给了肯尼亚当局。这位32岁的巴勒斯坦人供认，他们一伙共7人，来自埃及、黎巴嫩等国，爆炸行动得到藏匿在阿富汗的拉登资助，他们负责具体策划实施。另6人在爆炸当天从内罗毕经卡拉奇机场前往阿富汗，拉登的人在那儿欢迎他们。
一辆卡车向美国使馆区驶来，车上坐着五个中东模样的男子。发现异样情况后，值班警卫冲了上去。卡车被拦了下来，警卫人员与卡车上的歹徒发生交火，硝烟中看到有人从车上往下投掷手榴弹。
爆炸发生时，安装在使馆顶楼的安全摄像监视系统仍在工作。在爆炸发生之前，这台摄像机的镜头一直对着发生汽车爆炸的地点。
8月18日，联邦调查局的特工从犯罪嫌疑人侯瓦达口中了解了一个最新情况，对肯尼亚的山顶宾馆进行了突袭查抄，在两个房间里发现了80公斤梯恩梯。8月3日至8月7日，这两个房间住的是两名巴勒斯坦人、一名沙特人和一名埃及人，其中三名投放炸弹的人已在爆炸中毙命。
8月20日，在克林顿总统的命令下，美国海军轰炸了阿富汗和苏丹两处被认为“与恐怖分子有关系”的目标。克林顿称这是对恐怖分子日前针对美国驻肯尼亚和坦桑尼亚使馆的爆炸案所作的“反击”。
美国从驻扎在波斯湾的战舰上向阿富汗境内一个据称由沙特人拉登领导的恐怖分子的训练基地发射了导弹，与此同时，在红海的美国战舰向苏丹首都喀土穆附近一个被认作是制造化学武器的制药厂发射了导弹。
8月20日晚，喀土穆的穆斯林家庭正沉浸在周未聚会的欢乐气氛之中，不料北郊上空传来一阵巨响，坐落在工业区的希法制药厂遭到了美国飞机的猛烈轰炸。爆炸引起的大火熊熊燃烧，制药厂的一座三层楼房被夷为平地。当时正在车间值班的工人无一幸免，另有至少10名居住在工厂附近的市民被炸伤。
喀土穆的爆炸声刚刚停止，美国CNN有线电视网便立即插播克林顿宣布美国当天打击了苏丹和阿富汗“训练恐怖分子”的基地，并指责希法制药厂研制化学毒气的声明。
苏丹政府严厉谴责了美国的此次军事行动，并否认这家工厂与生产化学武器有关。
美国的此次空袭行动是在美国驻苏丹使馆宣布把全部美国外交人员撤到开罗一周后进行的。在美国驻坦桑尼亚和肯尼亚大使馆被炸之后，美国以安全为由，撤离了所有在喀土穆的美国外交人员，宣布由驻开罗的美国使团负责苏丹人的赴美签证和移民手续。
空袭发生后，喀土穆的市民们纷纷奔走相告，他们担心美国有可能对苏丹采取进一步行动。
克林顿返回华盛顿后在白宫椭园形办公室发表电视讲话时说，他下令轰炸上述两个目标是因为美国安全面临着威胁。美国情报部门认为，世界一些主要的恐怖主义领导人正准备在阿富汗与拉登会面，这使美国政府感到有必要迅速采取行动。
国防部长科恩和参谋长联席会议主席谢尔顿也在记者招待会上说，美国决不给恐怖分子任何一个避难所，美国将全力保护它在世界各地的利益。科恩还说，如有必要，美国还可能进行新一轮的打击。
美国进行袭击后，它的一些盟国对它表示了支持，但为数不多。尽管美国国务卿奥尔布赖特呼吁各国站在美国一边，反对恐怖主义，但是美国的行动却遭到世界许多国家特别是阿拉伯国家的普遍谴责和反对。阿拉伯世界早就不满美国偏袒以色列的立场，现在美国以反恐怖活动为由袭击苏丹和阿富汗两个伊斯兰国家，这种不满会大大加深。
空袭难以制止恐怖活动，这一点连许多美国人都这样认为。只有加强国际协调与合作，同时遵守联合国宪章和国际法准则，才能有效地打击国际恐怖活动。中国外交部发言人朱邦造在美国对苏丹和阿富汗进行袭击后表明了中国政府的上述立场。
俄罗斯总统新闻发言人亚斯特任布斯基21日说，叶利钦总统对美国轰炸阿富汗和苏丹感到气愤，并谴责美国的这一军事行动。俄罗斯外交部也发表声明说，美国对苏丹和阿富汗采取单方面的武力行动，不但无助于根除恐怖主义，反而会引起后果无法设想的连锁反应。
声明强调指出，美国的空袭行动在解决有争议问题的国际惯例中开创了一个危险的先例，破坏了当代国际关系的法律基础，不能不引起严重的关注。
声明说，俄罗斯坚决反对恐怖主义，强烈谴责最近对美国驻肯尼亚和坦桑尼亚使馆的恐怖行动。只有靠国际社会的共同努力，才能有效地进行反恐怖主义的斗争。声明强调，反恐怖主义的行动，应该遵循国际法的准则。
伊朗外交部发言人穆罕默迪说，美国的袭击是反对苏丹政府和人民的，这种行为不仅侵犯了苏丹的主权和领土完整，而且违背美国所承担的国际义务，“我们谴责这种行为”。他还说，伊朗一直谴责恐怖分子，但任何恐怖事件不能成为美国随意行动的借口。他对美国袭击苏丹和阿富汗造成大批无辜百姓伤亡表示遗憾。
马来西亚总理马哈蒂尔21日说，他的政府对美国空袭阿富汗和苏丹感到气愤，因为这一攻击被说成是得到了联合国的许可，但“我们并不知道联合国给予了许可。”
伊拉克谴责美国空袭阿富汗和苏丹，并表示支持苏丹人民反抗侵略。
联合国秘书长安南的发言人20日说，安南对美国空袭阿富汗和苏丹的所谓与恐怖分子有关的目标表示关切。
法国外交部21日发表公报说，法国政府注意到美国对苏丹和阿富汗一些设施进行的轰炸行动。法国认为，应该“由各国自己采取必要措施，同恐怖主义进行斗争”。
生活在澳大利亚悉尼的300多名阿富汗人23日举行集会，抗议美国空袭阿富汗。
希腊政府发言人雷帕斯24日说，为了报复美国向苏丹和阿富汗发动的导弹袭击，穆斯林恐怖分子可能会对希腊境内的美国目标进行袭击。为防止此类事件发生，希腊治安部队已经做好准备，将尽最大努力挫败任何恐怖主义行动。
在谈到美国向苏丹和阿富汗进行的导弹袭击事件时，雷帕斯说，希腊谴责“恐怖主义的暴力现象”，支持国际社会联合起来同这种现象作斗争，但希腊赞同边界的完整性与不可侵犯性，并认为在国际生活中应该以国际法准则为准绳。
